위의 기사에 따르면 개신교인 숫자는 우리 나라 총인구 숫자인 50,296,133의 18.6% 즉 9,053,303 명입니다.

제가 아는 한 싸이트에는 2001년 말을 기준으로 한 주요 교단별 숫자가 나옵니다.
그 숫자가 12,284,823 명입니다.
지금부터 약 2년 전이므로 변동이 생길 수 있지요.
http://www.mct.go.kr/cgi-bin/nph-hwp2html/tonggye/tonggye-data2/gyodan[1].hwp

차이가 약 300만이군요.
이유는 여러 가지가 있겠으나... 제가 가능한 이유를 적어 보겟습니다.
1) 기독교인이 엄청 죽었다. 2년 만에 어떤 특정 종교인이 갑자기 이렇게 300만명씩이나 죽었다면...
2) 기독교인 개종 혹은 탈 종교화 했다.
3) 기독교 통게가 뻥튀기 되었다.